中央空调故障E3一般是指控制器串口通讯出现异常，可能是控制器出现故障，也可能是与外部设备连接的接口线路出现了问题。解决方法如下：
1.首先，需要检查中央空调主机的控制器，看看是否有任何故障。可以先检查电源是否正常，如电源是否连接，电源是否开关，控制器是否损坏等问题。如果控制器出现故障，需要替换故障控制器。
2.其次，需要检查控制器的通讯接口线路，确保连接正确，并检查通讯线路的质量和连通性。如果连接线路出现故障，需要更换故障线路。在更换线路时，应该选择优质的线材，确保通讯信号的稳定性与准确性。
3.最后，需要在中央空调系统中重新配置通讯协议。可以参考设备的说明书，根据实际情况进行设置。设置时需要注意协议的参数，例如波特率、数据位数、校验位等。如果设置不正确，通讯将无法正常通信。
总之，如果中央空调故障E3，应该首先检查控制器和通讯线路，以确保它们的正常工作。如果检查了这些组件，问题仍然存在，则可能需要找到其他的故障点，例如建筑物内的电气系统或者其他设备故障等，并及时解决，以确保中央空调系统的正常运作。
